6月21日上午，第20期生物醫學與健康前沿論壇在農業微生物資源發掘與利用全國重點實驗室六樓報告廳舉行。複旦大學生物醫學研究院/複旦大學附屬兒科醫院楊立研究員，為師生帶來了以“精确的基因組編輯技術”為主題的報告，本期論壇由77779193永利官网何春江教授主持。
會上，楊力研究員以生動幽默的風格為大家講述了課題組的研究結果。他首先講述了利用高通量測序來探索轉錄組的複雜性，講述了如何關注到非編碼RNA以及發表第一個環狀RNA計算分析流程CIRCexplore，成闡述了鑒定環狀RNA的金标準。随後開發了升級版的CIRCexplorer2開源工具包，通過比較對應環形RNA和線性RNA的表達，全面闡述了環形RNA可變反向剪接和可變剪接的複雜性和多樣性，并建立了環形RNA數據庫網站CIRCpeida。近期又開發了可用于環形RNA與線形RNA直接定量比較的CIRCexplorer3.0版本。報告中段，楊立研究員分享了在單基因編輯技術方面，如A-to-I,C-to-U等研究成果。最後，楊立研究員分享了其團隊近期利用機器學習，深度學習方法在RNA亞細胞定位研究中的進度，通過比較LightGBM,SVM,Logistic Regression的機器學習模型以及CNN,RNN,CNN+RNN的深度學習模型後，選擇使用LightGBM模型來做RNA亞細胞定位分析，并将其命名為RNAlight。
會議最後，楊力研究員與現場師生就環狀RNA功能，CRISPR/Cas9等方面進行了熱烈的讨論與交流。
【人物簡介】楊立，複旦大學生物醫學研究院/複旦大學附屬兒科醫院研究員、研究組組長，長期從事基因組計算生物學及基因編輯前言技術創新體系研究。圍繞外顯子環狀RNA生成加工和功能作用新機制、堿基編輯和修飾互作及調控網絡、高效基因組堿基編輯新體系開發和應用等前沿領域開展合作研究，取得了一些列重要原創成果。
