專任教師

陳振夏

訪問次數:發布日期:2019-09-19

陳振夏 博士教授 博士生導師

77779193永利官网精準營養與代謝創新團隊陳振夏課題組成立于2016年9月,主要利用“果蠅-脊椎動物-人”比較基因組學研究策略,通過動物和人類營養健康的多組學數據整合分析,評估“基因-性别-營養”相互作用對機體的影響及其分子機制,力求為國民提供個性化的膳食營養方案,治未病。

實驗室主要研究方向包括:

1.食品營養健康效用挖掘;

2.動物表型組學技術開發;

3.非編碼結構元件功能和演化研究。


教育經曆

2006-2011北京大學生命科學技術學院生物信息中心理學博士學位

2002-200677779193永利官网生命科學技術學院國家生命科學與技術人才培養基地理學學士學位

2003-2006武漢大學新聞傳播學院新聞學文學學士學位


工作經曆

2022至今Briefings in Bioinformatics副主編(Deputy Editor)

2021-2022Briefings in Bioinformatics副編輯(Associate Editor)

2016-至今77779193永利官网教授、博士生導師

2011-2016美國國立衛生研究院消化、糖尿病、腎髒病研究所博士後


講授課程

《演化生物學》《生物信息學》《生命科學導論》《生命科學發展簡史》


代表性科研論文

1. Zhang R#, Tu YX#, Ye D, Gu Z,Chen ZX*, Sun Y*. 2022. A Germline-specific Regulator of Mitochondrial Fusion is Required for Maintenance and Differentiation of Germline Stem and Progenitor Cells.Advanced Science.

2. Chen L#, Luo Z#, Zhao C#, Li Q, Geng Y, Xiao Y, Chen MK, Li L,Chen ZX*, Wu M*. 2022. Dynamic Chromatin States Coupling with Key Transcription Factors in Colitis‐Associated Colorectal Cancer.Advanced Science.

3. Qian SH, Xiong YL, Chen L, Geng YJ, Tang XM,Chen ZX*. 2022. Dynamic Spatial-temporal Expression Ratio of X Chromosome to Autosomes but Stable Dosage Compensation in Mammals.Genomics Proteomics Bioinformatics.

4. Luo ZH#, Zhu LD#, Wang YM#, Hu Qian S, Li M, Zhang W*,Chen ZX*. 2022. DSEATM: drug set enrichment analysis uncovering disease mechanisms by biomedical text mining.Brief Bioinform.

5. Li Z#, Qian SH#, Wang F, Mohamed HI, Yang G,Chen ZX*, Wei D*. 2022. G-quadruplexes in genomes of viruses infecting eukaryotes or prokaryotes are under different selection pressures from hosts.J Genet Genomics49: 20-29.

6. Liu X#, Chen L#, Wang T, Zhou J, Li Z, Bu G, Zhang J, Yin S, Wu D, Dou C et al. 2021. TDG is a pig-specific epigenetic regulator with insensitivity to H3K9 and H3K27 demethylation in nuclear transfer embryos.Stem Cell Reports.

7. Tong YB#, Shi MW#, Qian SH#, Chen YJ, Luo ZH, Tu YX, Xiong YL, Geng YJ, Chen C,Chen ZX*. 2021. GenOrigin: A comprehensive protein-coding gene origination database on the evolutionary timescale of life.J Genet Genomics48: 1122-1129.

8. Luo ZH, Shi MW, Yang Z, Zhang HY,Chen ZX*. 2020. pyMeSHSim: an integrative python package for biomedical named entity recognition, normalization, and comparison of MeSH terms.BMC Bioinformatics21(1): 252.

9. Chen L, Wang L, Cheng Q, Tu YX, Yang Z, Li RZ, Luo ZH,Chen ZX*. 2020. Anti-masculinization induced by aromatase inhibitors in adult female zebrafish.BMC Genomics21(1): 22.

10. Shi MW#, Zhang NA#, Shi CP, Liu CJ, Luo ZH, Wang DY, Guo AY*,Chen ZX*. 2019. SAGD: a comprehensive sex-associated gene database from transcriptomes.Nucleic Acids Res47(D1): D835-D840.

11.Chen ZX, Oliver B, Zhang YE, Gao G, Long M*. 2017. Expressed Structurally Stable Inverted Duplicates in Mammalian Genomes as Functional Noncoding Elements.Genome Biol Evol9(4): 981-992.

12.Chen ZX, Oliver B*. 2015. X Chromosome and Autosome Dosage Responses in Drosophila melanogaster Heads.G3(Bethesda) 5(6): 1057-1063.

13.Chen ZX#, Sturgill D#, Qu J, Jiang H, Park S, Boley N, Suzuki AM, Fletcher AR, Plachetzki DC, FitzGerald PC et al. 2014. Comparative validation of the D. melanogaster modENCODE transcriptome annotation.Genome Res24(7): 1209-1223.

14.Chen ZX, Golovnina K, Sultana H, Kumar S, Oliver B*. 2014. Transcriptional effects of gene dose reduction.Biol Sex Differ5(1): 5.

15.Chen ZX, Zhang YE, Vibranovski M, Luo J, Gao G, Long M*. 2011. Deficiency of X-linked inverted duplicates with male-biased expression and the underlying evolutionary mechanisms in theDrosophilagenome.Mol Biol Evol28(10): 2823-2832.


發表社科文章

1.龍漫遠,陳振夏.達爾文和他改變的世界.科學文化評論. 6(4): 13-26 (2009).

2.陳振夏.大學生課外活動參與狀況調查與研究.77779193永利官网學報(社科版), 5,6: 118-121 (2005).


其他發表文章

1.陳振夏.果蠅的祖先天生雙性戀?牛頓科學世界, (2010)

2.陳振夏. Y染色體少了,男人要沒了?南都周刊, (2009)

3.陳振夏.興趣不是奢侈品. ——從喜歡花鳥蟲魚的日本皇子說起.科學時報, (2008).

4.陳振夏.《在燕園留下的第一次》.霍曉丹編著.《絢彩燕園青春北大——60位北大優秀畢業生的校園記憶》,北京大學出版社(2011).


本實驗室動态

中文主頁:https://lab.rjmart.cn/10139/chenzxlab

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微信公衆号“EvoDevo好好玩”,本實驗室創建,内容包括演化發育基因組學領域的文獻推薦、學習資源、技術博客、學術活動等。

QQ讨論群JC Bioinformatics(653435863),本實驗室創建,面向全校生信愛好者,進行生物信息學技術交流和資源分享,并發布生物信息學興趣小組線下活動通知。


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